厦门市中医院（北京中医药大学厦门医院、厦门华侨医院）创办于1956年，2008年通过三级中医医院评审， 2017年成为北京中医药大学与厦门市人民政府合作共建单位，纳入北京中医药大学直属序列管理。同时是福建中医药大学附属厦门中医院、厦门大学医学院临床教学医院、厦门医学院教学医院。为国家中医住院医师规范化培训基地，国家中医类别全科医师规范化培训基地，中华中医药学会中药临床药师培训基地，国家药物临床试验机构。 2019年国家公立三级中医医院绩效考核等级A级，全国排名66位，福建省排名首位。2020年艾力彼中国中医医院百强排名41位。是国家卫生健康委建立健全现代医院管理制度全国试点、福建省3家名优中医院建设单位之一。2020年成为福建省省级文明单位。 现有2个国家临床重点专科：肝病科、儿科；1个国家中医药管理局重点学科；4个国家中医药管理局重点专科：肝病科、肛肠科、儿科、脾胃病科；2个国家中医药管理局重点专科建设单位。脾胃病科、风湿病科、骨伤科、糖尿病科、针灸康复科5个省级医疗“创双高”临床重点专科（中医类）建设项目。中西医结合胆胰专科、中西医结合骨关节病、中医痔疮专科、中西医结合儿科、中药临床药学、中医护理、中医眼科等10个省级重点专科。肛肠科、中西医结合儿科、肝病科3个厦门市医学领先学科。肝病科、儿科获评艾力彼“中国中医医院最佳研究型专科”，肝病科、儿科、肛肠科、骨伤科、内分泌科、脾胃病科、心血管科、针灸康复科获评艾力彼“中国中医医院最佳临床型专科”。 建有国家中医药管理局中医药防治传染病重点研究室、福建省博士后创新实践基地、北京中医药大学肝病、儿科、中医外科3个IV级研究所、厦门市盆底动力学重点实验室、分子病理实验室等科研平台。17个专业具备开展药物临床试验资格，居福建省中医系统首位。承办的《中医药通报》杂志是中华中医药学会主办的系列杂志之一。

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