厦门市中医院脾胃病科成立于上世纪70年代，2002年成为国家中医药管理局重点专病建设单位，2006年成为国家中医药管理局重点专病，慢性胃炎协作组副组长单位，福建省中医脾胃病重点专科，厦门市重点专科，2012年成为国家中医药管理局重点专科、国家药监局临床药物试验机构，现建有国家级名老中医涂福音传承研究室、国家级名老中医吴耀南传承研究室，在脾胃病诊治方面积累了丰富的临床经验。
经过几代人的创建与传承，厦门市中医院脾胃科已形成了以国家级名老中医涂福音教授（主任医师，教授，硕士生导师，厦门市中医院名誉院长，全国第二批、福建省第二批老中医药专家学术经验继承工作指导老师，全国名老中医传承工作室建设项目专家，享受国务院特殊津贴，获全国首届中医药传承特别贡献奖，中共厦门市委、市政府颁发的“科技先进个人”，厦门市科技进步三等奖，厦门市卫生系统优秀院长称号）、吴耀南教授（医学博士，主任医师，硕士研究生导师，北京中医药大学及福建中医药大学教授，福建省名老中医，第六批全国老中医药专家学术经验继承指导老师，全国200名优秀中医临床人才，原厦门市中医院副院长）为楷模，以郭健苗主任医师、陈一斌主任医师为学科带头人，众多崭露头角的青年才俊为后备力量的人才队伍。现有教授3人，中高级专业技术人才11人，博士、硕士11人，享受国务院特殊津贴专家1人，博士研究生导师1人，硕士研究生导师2人，担任中华中医药学会及中药医学会各专业委员会委员专家3人。
脾胃病专科以传统医学为主，医、教、研为一体，科室包括专科门诊、专科病房、内镜中心和脾胃病研究室等。现拥有床位40张，年门诊量6万多人次，年收住病人1千6百多人次。拥有各种先进的理化检查设备，如OLYMPUS GIF-XQ240电子胃镜、TIF240电子十二指肠镜、电子结肠镜、胶囊内镜、碳13检测仪、食道阻抗-PH联合监测系统、微波治疗仪、灸疗床等大量较先进的医疗设备，内镜中心开展了电子胃镜、电子肠镜检查及镜下注射、镜下套扎、镜下组织胶注射、球囊扩张、EMR、ESD、ERCP、STER、POEM等高难度镜下治疗。
我科在科学研究方面亦传承有序，曾承担过数项国家级、省市级科研课题，取得优异成果，科研实力雄厚。我科长期承担北京中医药大学、福建中医药大学本科及研究生的临床带教任务，福建中医药大学本科班的教学任务，中医住院医师规范化培训的临床带教任务。教学成就优异，多次被评为我院先进带教科室，教学主任被评为优秀教学主任，教学秘书被优秀教学秘书、多名带教老师被评为优秀带教老师。 
特色诊疗：
厦门市中医院确定了胃脘痛（慢性胃炎）、久痢（溃疡性结肠炎）、胃疡病（消化性溃疡）、血证（急性上消化道出血）、胰瘅（急性胰腺炎）等为专科的优势病种，制定的诊疗方案纳入了中医特色疗法、中医诊疗设备、适宜技术、中成药、现代技术等内容。专科研制了11种院内专科制剂，已广泛应用于临床。在学术创新上提出“脾虚湿热血瘀”的学术新观点，并应用理论创新开展了以下中医特色疗法：1、应用健脾清热利湿活血法抗幽门螺杆菌（HP）感染；2、应用健脾清热利湿活血法治疗慢性胃炎；3、研制“九红膏”治疗胃脘痛（慢性萎缩性胃炎）。在外治方面，我科秉承祖国医学中医外治疗法的精髓，根据涂福音教授经验，改良、创新了多种中医外治特色疗法，并开发了数十种外治院内制剂，包括坤土药粉（暖胃散、醒脾散、调枢散、四黄散、清胰散等）、足浴药粉（安神方、活血行气方、祛湿方、温阳方、疏肝解郁方、养阴方、清热方、益气方等）。针对不同疾病，开展了腹针疗法、药物穴位敷贴、烫熨治疗、耳穴埋豆治疗、中药保留灌肠、艾盒灸法、灸疗床、穴位埋针等多种中医外治相结合疗法。
远景目标：
    通过开展中医特色优势重点专科建设，努力形成医疗、科研、教学、管理密切切合并互进的学科建设良性运行机制。使我科成为基本设施和医疗设备先进，医疗技术领先、中医特色突出、治疗方法独特、专科优势明显、创新能力较强的综合性科室，进一步适应医疗市场竞争，并通过和内镜中心、介入诊疗科室、普外科、肝胆胰外科、临床药学室等相关科室展开合作，带动全员医疗卫生技术水平的整体提高。

中医特色疗法：1、应用健脾清热利湿活血法抗幽门螺杆菌（HP）感染；2、应用健脾清热利湿活血法治疗慢性胃炎；3、研制“九红膏”治疗胃脘痛（慢性萎缩性胃炎）。在外治方面，我科秉承祖国医学中医外治疗法的精髓，根据涂福音教授经验，改良、创新了多种中医外治特色疗法，并开发了数十种外治院内制剂，包括坤土药粉（暖胃散、醒脾散、调枢散、四黄散、清胰散等）、足浴药粉（安神方、活血行气方、祛湿方、温阳方、疏肝解郁方、养阴方、清热方、益气方等）。针对不同疾病，开展了腹针疗法、药物穴位敷贴、烫熨治疗、耳穴埋豆治疗、中药保留灌肠、艾盒灸法、灸疗床、穴位埋针等多种中医外治相结合疗法。