厦门市中医院药学部，是集药事管理、药学服务等于一体的药学专业技术科室，目前在职员工108人，其中高级职称药师18人，中级职称药师37人，国家中药特色技术传承人才9名。药学部下设门诊中药房、病区中药房、煎药房、门急诊西（中成药）药房、病区药房、临床药学室、制剂室等多个部门，除保障临床所需药品的采购、质量管理、调剂、医院制剂配制等工作外，药学部积极开展以“以合理用药为核心”的临床药学工作，包括处方点评、药师参与查房、药学门诊、不良反应监测、抗菌药物专项治理、药学信息服务、教学科研等多项工作，努力为临床提供多元化的药学技术服务。厦门市中医院是全省规模最大的三级甲等中医院之一，药学部每年接收培训省内外药学及临床实习生80余人。2017年，获批成为中华中医药学会中药临床药师培训基地，每年招收脾胃病科和儿科专业学员数名。2019年，我科获批成为福建省首批中药临床药学重点专科创建单位。科研方面：近5年，发表药学相关学术论文100余篇；参编《医院药师日记》、《中药注射剂安全应用案例分析》等临床药学专业书籍；主持国家级、省市级、福建中医药大学校管等课题10余项。获得荣誉：
2010年，药学党支部获厦门卫生系统“先进基层党组织”荣誉称号；
2011年，获国家食品药品监督管理局“全国药品不良反应工作先进单位”荣誉称号；
2015年，药师彭清华、郭瑶尝取得第一届全国药师技能大赛厦门赛区第一名；
2015年，中药房获得厦门市总工会颁发的“工人先锋号”荣誉称号；
2015年，中药房获厦门市级“青年文明号”荣誉称号；
2016年，药师陈水钫、张伟萍取得第二届全国药师技能大赛厦门赛区第一名；
2016年，中药房获福建省级“青年文明号”荣誉称号；
2017年，西药房获厦门市级“青年文明号”荣誉称号；
2017年，获批成为中华中医药学会中药临床药师培训基地；
2019年，获批成为福建省首批中药临床药学重点专科创建单位；
2020年，药师舒文琳获得2020年全国药学服务经典案例评选厦门赛区一等奖；
2021年，谢淳甸、徐韵菁获得第七届全国药师技能大赛厦门赛区二等奖；
2021年，郑重践获得2021年全国药学服务经典案例评选厦门赛区二等奖；
2021年，蔡颖莲获得首届厦门市执业中药师职业技能短视频科普大赛一等奖；
2021年，福建省中药传统技能大赛（福建省卫生健康委员会、福建省总工会主办）团体总分第一、陈雪梅获优秀指导老师、陈文娟个人总分第一并获得“五一劳动奖章；

| 中药房 |
中药房现有职工39人，其中硕士1人，本科以上学历34人。其中副主任药师1人，主管药师11人，中药师18人。中药房采用中药小包装饮片，具有保持饮片特色、剂量准确、饮片纯净卫生等特点；制定了中药饮片采购评估遴选制度，严格把控中药饮片质量；同时采用小包装中药饮片智能存取系统，加快调配速度，保证准确性，属全省首创。同时，我们为病患提供了中医儿科散剂、中药免煎颗粒剂、中药全成分颗粒剂等多种中药剂型，方便病患选择。行业服务有特色：提供中药代煎代送服务；为患者提供膏方熬制服务；提供更加方便服用携带的药品；定期在候药区发放中医药健康宣教手册；设立中药材实物展示柜，示教“真”“假”“优”“劣”辨别。
| 西药房 |
总院西药房现有职工20人，硕士学历2人，本科学历18人。其中取得主管药师资格13人，药师7人。总院西药房包括门诊药房和急诊药房，24小时开放。在药学部的领导下，主要承担总院门、急诊西药和中成药的调剂和发放工作，监督药品质量，做好药品效期管理；每月进行处方点评工作，对门、急诊普通处方、中成药处方实行综合点评，促进合理用药；为提高患者满意度，优化服务流程，安装了智能找药系统，让未及时和延时取药的患者能更加快速取药；为患者进行用药指导，特殊药品专门标签提醒；在窗口候药区摆放安全用药与健康读物，向公众宣传用药安全知识。
| 制剂室 |
制剂室始于1956年，拥有参术散，开胃灵等一批疗效显著，在厦门乃至闽南地区享有美誉的医院制剂，几十年来一直为我市及周边地区患者享受健康服务提供了优质的医院制剂。由于医院搬迁，改建，2015年，按照《医疗机构制剂配制质量管理规范》（GPP）于我院南区重新建成具有现代化提取、生产设备及配备先进质控仪器，集生产、科研、教学为一体的制剂中心大楼，并于2017年重新取得了《医疗机构制剂许可证》。制剂室设有提取车间，洁净配制区，药检室，仓贮区等，建筑面积达1538㎡。布局合理，设施先进，设备基本齐全，建有合剂、胶囊剂、洗剂、散剂、颗粒剂、软膏剂、灌肠剂等生产线。制剂室现有专业技术人员6人，副主任药师2人、主管药师2人，药师2人，均拥有执业药师资格。现有制剂批准文号品种33种，其中专科特色制剂21个，经过二十多年临床使用，价格低廉，疗效确切，深受广大患者好评。
| 临床药学室 |
药学部临床药学工作开展较早， 2006年开始就有专职临床药师每日下病房开展临床药学工作，目前已形成抗感染、呼吸、肠内肠外营养、心血管、风湿免疫、中药、通科、肿瘤等多个专业的临床药师团队。“重视临床实践与沟通，重视临床药学工作质量”，是我院临床药学工作的一大特色。临床药师通过实施药学监护、实时沟通、实时干预等参与临床实践，药学会诊、危重及疑难病例参与率、临床用药咨询数量逐年提高，工作质量得到临床认可。特色服务：“药师在您身边”微信在线患者咨询及用药教育平台；厦门市中医院互联网医院“患者线上咨询”。